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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

贵州遵义电厂社区——文明创建点亮夜经济******

　　傍晚时分，位于贵州遵义市红花岗区迎红街道电厂社区老电厂内的小野马城市营地里，亮起了氛围灯，燃起老式围炉，烤地瓜、烧烤、火锅等美食在折叠桌上铺散开来，精致悠闲的氛围感吸引了不少市民前来露营。

　　“冬天用围炉烤地瓜既传统又能取暖，氛围很棒，而且里面环境很好，非常适合与亲朋好友小聚。”家住电厂社区的王女士说，“这里的变化很大，以前的环境很不美观，现在打造成一处网红打卡地，不仅提升了城市颜值，还让市民在工作之余有了一个新的休闲去处。”

　　今年6月，小野马城市营地抓住露营热度升温的机遇应运而生。而在此前，这里是被闲置了几年的建筑工地员工休息区，多是坑坑洼洼的地面、乱停乱放的车辆、摇摇欲坠的工棚。

　　“在整治社区环境，巩固提升文明城市创建成果的过程中，如何盘活这几十亩地？我们与社区干部、居民代表商议，决定发展夜经济。”电厂社区党支部书记、主任简柱军说，确定了发展业态布局后，小野马城市营地率先入驻，丰富的产品业态、精细化设计的景观绿化、规范的门店管理，在带来烟火气的同时，也把城市一角装点得井然有序。

　　“营地以盘活城市闲置土地、激发周边消费活力、部分盈利反哺社区为主要运营模式，从而实现互利共赢。”小野马城市营地负责人杨熙雯介绍，营地设有30多个帐篷，日均接待游客300人左右，根据节日特点，适时推出民俗相关或节日专享等主题活动，并利用周边闲置资源开发“网红车摊”，进一步打造消费新业态，为大家提供更多更优质的消费体验。

　　城市闲置地变成夜经济新载体，不仅能激发消费活力，促进经济发展，也带动了居民就业。据介绍，小野马城市营地最多时有30多名员工，大部分为周边居民。“我在营地负责采购，一个月能拿4000多元工资，离家又近，比在外面打工要好得多。”电厂社区居民李汝筠在营地工作了半年，对工作很满意。

　　“以文明创建点亮夜经济，让消费更好地拉动经济，就是我们的工作目标。”简柱军说，社区还将科学规划场地布局，新建停车场，招商引进餐饮商家，丰富经营业态，规范夜经济集聚区域管理，让城市烟火气与文明同行，促进城市活力提升，推动辖区高质量发展。（人民日报 本报记者 汪志球 黄娴）

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）